Cambridge Structural Database 2017 晶體結(jié)構(gòu)分析軟件分享
Cambridge Structural Database 2017 晶體結(jié)構(gòu)分析軟件分享
文 / 利刃君
微信ID / ziyuanliren666
全文共2024字，推薦閱讀時間6分鐘。
劍橋結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)(The Cambridge Structural Database System，簡寫為CSDS)是基于X光和中子衍射實驗唯一的小分子及金屬有機分子晶體的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫，收錄了全世界范圍內(nèi)所有已認可的有機及金屬有機化合物的晶體結(jié)構(gòu)。
利刃君這里為大家分享Cambridge Structural Database 2017 晶體結(jié)構(gòu)分析軟件，資源可由文末獲取。
劍橋結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫
劍橋結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫（CSD）包含所有已出版的有機和金屬有機小分子晶體結(jié)構(gòu)的完整記錄。該數(shù)據(jù)庫已經(jīng)運行了50多年，并且仍然是跨學科共享結(jié)構(gòu)化學數(shù)據(jù)和知識的主要手段。除了公開支持科學文章的結(jié)構(gòu)外，它還包括許多直接作為CSD Communications發(fā)布的結(jié)構(gòu)。
CSD通過Cambridge Structural Database System 平臺提供服務(wù)，包括功能完整的應(yīng)用軟件，不僅具有數(shù)十種查詢化合物的方法，還提供了分子結(jié)構(gòu)信息統(tǒng)計方法和三維圖像演示方法，以幫助研究人員尋找、觀察、分析和總結(jié)有關(guān)的化合物信息。
數(shù)據(jù)庫中的每一條信息都包括：
1、三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)：原子坐標、晶胞參數(shù)、空間群、結(jié)構(gòu)精密度指標、溫度與壓力條件、無序分布細節(jié)
2、二維結(jié)構(gòu)圖：原子和鍵的性質(zhì)與關(guān)聯(lián)
3、化學式和化合物名稱，多肽化合物的氨基酸序列
4、完整的文獻資料，其中部分直接與電子版文獻連接
5、交叉引用立體異構(gòu)體及有關(guān)重新解釋和確認的詳情
6、其它已發(fā)表的與該分子有關(guān)的信息：化合物來源、結(jié)晶條件、結(jié)對構(gòu)型的確定實驗、多晶型現(xiàn)象（同質(zhì)多像）及生物活性。
在進入數(shù)據(jù)庫之前，所有結(jié)構(gòu)都需要通過計算和專家結(jié)構(gòu)化學編輯器進行處理。該過程的關(guān)鍵部分是所研究結(jié)構(gòu)的化學特性與實驗數(shù)據(jù)的可靠關(guān)聯(lián)。這一重要步驟有助于確保數(shù)據(jù)可廣泛發(fā)現(xiàn)并易于重用。該數(shù)據(jù)庫不斷收錄最新發(fā)表的數(shù)據(jù)信息，并以年9%的增長率不斷更新。
通過選擇性地包含其他實驗數(shù)據(jù)，可以進一步豐富內(nèi)容。任何人都可以通過免費的CSD社區(qū)Web服務(wù)獲得條目。由CCDC開發(fā)和維護的鏈接服務(wù)與標準標識符的使用相結(jié)合，有助于從其他資源中進行發(fā)現(xiàn)。還可以通過CCDC和第三方軟件應(yīng)用程序以及應(yīng)用程序編程接口來訪問數(shù)據(jù)。
CSDS 軟件分為基本軟件系統(tǒng)和圖形軟件系統(tǒng)。它不僅具有數(shù)十種查詢化合物的方法，還提供了分子結(jié)構(gòu)信息統(tǒng)計方法和三維圖像演示方法，以幫助研究人員尋找、觀察、分析和總結(jié)有關(guān)的化合物信息。
基本軟件系統(tǒng)和功能
QUSET 一維和二維信息查詢；
GSTAT多功能三維搜索和幾何計算；
PLUTO 把分子晶體結(jié)構(gòu)及它的環(huán)境以三維方式顯示出來。
圖形軟件系統(tǒng)和功能
QUEST3D 交互式的一維、二維和三維信息查詢程序;
PREQUEST 幫助檢查結(jié)構(gòu)及創(chuàng)建用戶自己的用于QUEST查詢的數(shù)據(jù)庫;
VISTA 對得到的數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析。
以上是CambridgeStructural Database晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫及軟件的的一個簡單介紹，更多詳細內(nèi)容可查看以下文獻了解：
Groom C R, Bruno I J,Lightfoot M P, et al. The Cambridge structural database[J]. ActaCrystallographica Section B: Structural Science, Crystal Engineering andMaterials, 2016, 72(2): 171-179.
CCDC是一個非盈利的科研組織，它的大部分經(jīng)費來源于各種資助，由出租CSDS收回的資金僅占全部費用的一小部分。它出租的對象分為非盈利的科研組織和盈利的商業(yè)組織。對這兩種組織收取的租費是不一樣的。CCDC要求非盈利的科研組織在使用CSDS時不能有任何形式的商業(yè)行為。
CCDC要求所有使用CSD的研究人員在發(fā)表文章時必須引用文獻:
3D Search and Research Using the CambridgeStructural Database, Allen, F.H. and Kennard, O. Chemical Design AutomationNews, 8 (1), pp 1 & 31-37, 1993.
資源獲取方式：
1.點擊頭像，添加關(guān)注；
2.點擊頭像，私信關(guān)鍵詞：037（注意關(guān)鍵詞不要多字少字，否則后臺無法識別）
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