Cambridge Structural Database 2017 晶體結(jié)構(gòu)分析軟件分享

文 / 利刃君

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劍橋結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)(The Cambridge Structural Database System，簡(jiǎn)寫(xiě)為CSDS)是基于X光和中子衍射實(shí)驗(yàn)唯一的小分子及金屬有機(jī)分子晶體的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)，收錄了全世界范圍內(nèi)所有已認(rèn)可的有機(jī)及金屬有機(jī)化合物的晶體結(jié)構(gòu)。

利刃君這里為大家分享Cambridge Structural Database 2017 晶體結(jié)構(gòu)分析軟件，資源可由文末獲取。

劍橋結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)

劍橋結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)（CSD）包含所有已出版的有機(jī)和金屬有機(jī)小分子晶體結(jié)構(gòu)的完整記錄。該數(shù)據(jù)庫(kù)已經(jīng)運(yùn)行了50多年，并且仍然是跨學(xué)科共享結(jié)構(gòu)化學(xué)數(shù)據(jù)和知識(shí)的主要手段。除了公開(kāi)支持科學(xué)文章的結(jié)構(gòu)外，它還包括許多直接作為CSD Communications發(fā)布的結(jié)構(gòu)。

CSD通過(guò)Cambridge Structural Database System 平臺(tái)提供服務(wù)，包括功能完整的應(yīng)用軟件，不僅具有數(shù)十種查詢(xún)化合物的方法，還提供了分子結(jié)構(gòu)信息統(tǒng)計(jì)方法和三維圖像演示方法，以幫助研究人員尋找、觀察、分析和總結(jié)有關(guān)的化合物信息。

數(shù)據(jù)庫(kù)中的每一條信息都包括：

1、三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)：原子坐標(biāo)、晶胞參數(shù)、空間群、結(jié)構(gòu)精密度指標(biāo)、溫度與壓力條件、無(wú)序分布細(xì)節(jié)

2、二維結(jié)構(gòu)圖：原子和鍵的性質(zhì)與關(guān)聯(lián)

3、化學(xué)式和化合物名稱(chēng)，多肽化合物的氨基酸序列

4、完整的文獻(xiàn)資料，其中部分直接與電子版文獻(xiàn)連接

5、交叉引用立體異構(gòu)體及有關(guān)重新解釋和確認(rèn)的詳情

6、其它已發(fā)表的與該分子有關(guān)的信息：化合物來(lái)源、結(jié)晶條件、結(jié)對(duì)構(gòu)型的確定實(shí)驗(yàn)、多晶型現(xiàn)象（同質(zhì)多像）及生物活性。

在進(jìn)入數(shù)據(jù)庫(kù)之前，所有結(jié)構(gòu)都需要通過(guò)計(jì)算和專(zhuān)家結(jié)構(gòu)化學(xué)編輯器進(jìn)行處理。該過(guò)程的關(guān)鍵部分是所研究結(jié)構(gòu)的化學(xué)特性與實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的可靠關(guān)聯(lián)。這一重要步驟有助于確保數(shù)據(jù)可廣泛發(fā)現(xiàn)并易于重用。該數(shù)據(jù)庫(kù)不斷收錄最新發(fā)表的數(shù)據(jù)信息，并以年9%的增長(zhǎng)率不斷更新。

通過(guò)選擇性地包含其他實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，可以進(jìn)一步豐富內(nèi)容。任何人都可以通過(guò)免費(fèi)的CSD社區(qū)Web服務(wù)獲得條目。由CCDC開(kāi)發(fā)和維護(hù)的鏈接服務(wù)與標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)識(shí)符的使用相結(jié)合，有助于從其他資源中進(jìn)行發(fā)現(xiàn)。還可以通過(guò)CCDC和第三方軟件應(yīng)用程序以及應(yīng)用程序編程接口來(lái)訪問(wèn)數(shù)據(jù)。

CSDS 軟件分為基本軟件系統(tǒng)和圖形軟件系統(tǒng)。它不僅具有數(shù)十種查詢(xún)化合物的方法，還提供了分子結(jié)構(gòu)信息統(tǒng)計(jì)方法和三維圖像演示方法，以幫助研究人員尋找、觀察、分析和總結(jié)有關(guān)的化合物信息。

基本軟件系統(tǒng)和功能

QUSET 一維和二維信息查詢(xún)；

GSTAT多功能三維搜索和幾何計(jì)算；

PLUTO 把分子晶體結(jié)構(gòu)及它的環(huán)境以三維方式顯示出來(lái)。

圖形軟件系統(tǒng)和功能

QUEST3D 交互式的一維、二維和三維信息查詢(xún)程序;

PREQUEST 幫助檢查結(jié)構(gòu)及創(chuàng)建用戶(hù)自己的用于QUEST查詢(xún)的數(shù)據(jù)庫(kù);

VISTA 對(duì)得到的數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。

以上是CambridgeStructural Database晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)及軟件的的一個(gè)簡(jiǎn)單介紹，更多詳細(xì)內(nèi)容可查看以下文獻(xiàn)了解：

Groom C R, Bruno I J,Lightfoot M P, et al. The Cambridge structural database[J]. ActaCrystallographica Section B: Structural Science, Crystal Engineering andMaterials, 2016, 72(2): 171-179.

CCDC是一個(gè)非盈利的科研組織，它的大部分經(jīng)費(fèi)來(lái)源于各種資助，由出租CSDS收回的資金僅占全部費(fèi)用的一小部分。它出租的對(duì)象分為非盈利的科研組織和盈利的商業(yè)組織。對(duì)這兩種組織收取的租費(fèi)是不一樣的。CCDC要求非盈利的科研組織在使用CSDS時(shí)不能有任何形式的商業(yè)行為。

CCDC要求所有使用CSD的研究人員在發(fā)表文章時(shí)必須引用文獻(xiàn):

3D Search and Research Using the CambridgeStructural Database, Allen, F.H. and Kennard, O. Chemical Design AutomationNews, 8 (1), pp 1 & 31-37, 1993.

資源獲取方式：

1.點(diǎn)擊頭像，添加關(guān)注；

2.點(diǎn)擊頭像，私信關(guān)鍵詞：037（注意關(guān)鍵詞不要多字少字，否則后臺(tái)無(wú)法識(shí)別）

就可獲取這款Cambridge Structural Database 2017 晶體結(jié)構(gòu)分析軟件啦~