秦巴山區(qū)三種人參屬藥用植物葉綠體基因組特征分析
為明確珠子參、羽葉三七和秀麗假人參3種藥用植物葉綠體基因組特征與系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,該文以秦巴山區(qū)3種人參屬藥用植物為研究對(duì)象,運(yùn)用生物信息學(xué)技術(shù),分析其葉綠體基因組特征及密碼子使用偏好性,并探討三者之間的親緣關(guān)系。結(jié)果表明:(1)3種人參屬藥用植物的葉綠體基因組為典型的四分體結(jié)構(gòu),序列全長(zhǎng)為 156 071~156 104 bp,總 GC 含量為 38.10%,基因組大小相似度較高。(2)均注釋到 133 個(gè)基因,包括 88 個(gè)蛋白編碼基因,37個(gè)IRNA基因和8個(gè)INA 基因。(3)3種人參屬藥用植物葉綠體密碼子使用偏好性相似,密碼子第 3 位堿基以 A/U 結(jié)尾為主,密碼子使用模式在受到突變影響的同時(shí),主要受到自然選擇的影響。(4)系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果顯示,3種人參屬藥用植物的親緣關(guān)系較近,并且秀麗假人參同羽葉三七親緣關(guān)系更近。綜上認(rèn)為,秀麗假人參與珠子參基源植物之間存在近緣關(guān)系,這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)對(duì)于珠子參中藥材的資源開發(fā)利用和分子鑒定,以及進(jìn)一步研究人參屬物種的分類,系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化機(jī)制提供了重要依據(jù)。
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